Tom and Jerry: The Movie menceritakan petualangan Tom dan Jerry yang terpaksa menjadi tunawisma setelah rumah mereka hancur, lalu bertemu Robyn Starling, gadis yatim piatu yang kabur dari bibinya yang kejam, Bibi Figg. Mereka bersatu untuk menyelamatkan Robyn, menghadapi berbagai penjahat yang menginginkan hadiah untuk menemukannya, dan akhirnya menemukan bahwa ayah Robyn masih hidup. Film ini berbeda karena menampilkan lagu-lagu musikal dan dialog, dengan Tom dan Jerry akhirnya menjadi teman sementara sebelum kembali ke kejar-kejaran klasik di akhir.
- Kehilangan Rumah: Tom dan Jerry ditinggalkan dan rumah mereka dihancurkan, memaksa mereka untuk hidup bersama dan bekerja sama.
- Bertemu Robyn: Mereka bertemu Robyn Starling, seorang gadis yang kabur dari Bibi Figg yang jahat.
- Misi Penyelamatan: Tom dan Jerry berjanji untuk membantu Robyn menemukan ayahnya, yang mereka curigai masih hidup, meskipun Bibi Figg berusaha mencegahnya.
- Perjalanan dan Bahaya: Mereka melarikan diri dari Figg dan antek-anteknya (termasuk Lickboot dan Ferdinand), menghadapi berbagai karakter seperti Kapten Kiddie, dan akhirnya menemukan petunjuk tentang ayah Robyn.
- Konflik Puncak: Pertemuan di sebuah kabin berakhir dengan kebakaran, di mana Tom dan Jerry menyelamatkan Robyn.
- Resolusi: Ayah Robyn tiba dengan helikopter, menangkap para penjahat, dan mengadopsi Tom dan Jerry.
- Akhir Klasik: Tom dan Jerry memulai hidup baru di vila mewah Robyn, tetapi segera kembali ke persaingan abadi mereka, mengakhiri film dengan adegan kejar-kejaran khas.