Wonder Woman: Bloodlines bercerita tentang Putri Amazon, Diana, yang meninggalkan Themyscira untuk menyelamatkan seorang pilot yang jatuh, Steve Trevor, dari serangan penjahat setan. Dalam petualangan pertamanya di dunia manusia, ia juga harus membantu seorang gadis muda bermasalah bernama Vanessa, yang telah bergabung dengan organisasi mematikan bernama Villainy Inc.. Diana harus melawan penjahat yang semakin kuat sambil mencari cara untuk menyelamatkan teman-temannya dan dunia manusia.
- Pen menyelamatkan Steve Trevor: Diana meninggalkan rumahnya untuk menolong Steve Trevor, seorang pilot AS yang pesawatnya jatuh di dekat Themyscira.
- Pertemuan dengan dunia luar: Diana belajar tentang dunia luar dan mendapatkan julukan Wonder Woman saat ia menolong Steve dan berusaha membantu Vanessa.
- Perjuangan melawan Villainy Inc.: Diana harus berjuang melawan kelompok penjahat yang dikenal sebagai Villainy Inc. dan pimpinannya, Dr. Cyber, yang berniat untuk menaklukkan Themyscira.
- Transformasi Vanessa: Vanessa, yang terpengaruh oleh trauma dan lingkungan sekitarnya, menjadi jahat dan bergabung dengan Villainy Inc. sebagai Silver Swan.
- Perjuangan dan rekonsiliasi: Wonder Woman harus menghadapi berbagai penjahat, termasuk Medusa, sambil berjuang untuk mendapatkan kembali teman-temannya dan memperbaiki hubungan dengan ibunya, Hippolyta.